西安交通大学医学部前身是国立北京医学专门学校，成立于1912年10月26日，是中国政府举办的第一所国立西医学校。1928年更名北平大学医学院。1937年抗日战争全面爆发，为反抗日本侵略，师生西迁陕西，组建西安临时大学医学院，开创西北高等医学教育先河。后几经易名，1950年改称为西北医学院，1956年改称西安医学院，1985年更名为西安医科大学。2000年4月西安医科大学与西安交通大学、陕西财经学院三校合并，更名为西安交通大学医学院，2012年6月组建西安交通大学医学部。

　　医学部拥有基础医学院、第一临床医学院(第一附属医院)、第二临床医学院(第二附属医院)、口腔医学院(附属口腔医院)、公共卫生学院、药学院、法医学院、护理学系8个教学实体单位;设立转化医学研究院、Med-X研究院、药物科学与技术研究院、生物证据研究院、全球健康研究院、精准医疗研究院等6个研究院;建有实验动物中心、生物医学实验研究中心等教学科研机构。

　　医学部现有生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、口腔、护理学7个一级学科博士学位授权点，3个博士专业学位授权点;8个一级学科硕士学位授权点，6个硕士专业学位授权点。有6个一级学科博士后科研流动站，拥有4个国家重点学科(生理学、法医学、泌尿外科和皮肤病与性病学)，25个国家临床重点专科，2个国家级疑难病症诊治能力提升工程项目(呼吸系统疾病和心脑血管疾病)，12个省级重点学科，12个省级优势学科。拥有13门国家级一流本科课程，53门国家、省、校级“精品课程”，3门国家级和省级双语示范课程，5个国家和省级优秀教学团队。临床医学、药理与毒理学、生物与生物化学、神经科学与行为学、分子生物学与遗传学、免疫学等6个学科进入ESI全球前1%行列。